执行院长

主持系统科学研究院全面行政工作，负责人事、财务、资产等工作。

副院长

分管研究院教学工作，协助分管行政工作。

副院长

分管研究院科学研究工作。

副院长

分管研究院学科建设、对外交流与新闻宣传工作。

院长助理

协助分管人事、财务、资产和系统科学学科建设等工作。

院长助理

协助分管网站宣传，院务会，对外交流等工作。

院长助理

协助分管科研，开放课题，学术会议等工作。